Fichiers - Bases de Données

L'outil informatique est un apport considérable en recherche scientifique car il permet de d'enregistrer une grande quantité de données de façon très structurée ce qui est impératif pour la réalisation de traitements complexes.

Mais la conception et l'entretien d'une base de données ne sont pas chose facile si l'on veut qu'elle puisse être utilisée de façon optimale. Il est donc essentiel de pouvoir s'appuyer sur les compétences d'une équipe informatique qui travaillera en parfait partenariat avec le ou les concepteur(s) et les partenaires.

L'utilisation de la "machine" informatique nécessite de représenter l’information sous une forme logique interprétable par un ordinateur.

Trois questions sont à poser :

• De quelles informations dispose-t-on pour répondre à l'hypothèse de départ ?
• Comment structure-t-on les données pour que le système informatique puisse les utiliser ?
• Où les stocke-t-on ?

À chacune de ces questions une réponse est obtenue grâce :

• Au modèle conceptuel (MCD)*,
• À la modèle logique (MLD)*,
• Aux tables.

Niveau conceptuel	Données	MCD
Niveau logique	Structure	MLD
Niveau physique	Stockage	Tables et index

Toutes ces données seront explicitées dans le cahier des charges (cf ci-dessous "cahier des charges) fourni à l'équipe informatique chargée de développer le logiciel.

2.1. Les Bases de Données Relationnelles

Une base de données* est un ensemble structuré et organisé de fichiers permettant le stockage et l'accès aux informations (exemple : un carnet d'adresses est une base de données car c'est un carnet structuré en répertoire, organisé par lettres alphabétiques ou sont stockés de façon ordonnée les noms/adresse/téléphone des contacts ce qui permet de retrouver facilement un numéro de téléphone).

L'apport de l'outil informatique est essentiel lorsque :

• le nombre d'informations à enregistrer devient trop important (exemple : les pages blanches de tous les annuaires de France),
• la conception de la base de données n'est pas prévue pour répondre à une question (exemple : trouver toutes les personnes qui habitent Toulouse alors qu'elles sont classées par ordre alphabétique de leur Nom),
• les recherches portent sur plus d'une donnée (exemple : rechercher les numéros de téléphone de toutes les personnes qui habitent Toulouse et qui ont un fax).

Pour résoudre ces problèmes il faut ajouter une 3^e dimension qui est la structuration des données, qui ne peut être obtenue qu'avec un outil informatique qui est la base de données relationnelle*. Elle permet de structurer les données de façon à ce qu'elles soient agencées en entités, liées les unes aux autres par des relations* :

• les données sont regroupées par classe d'objet ou entité (exemple : pathologie),
• chaque entité regroupe tous les objets de la même classe (exemple : l'entité pathologie contient la maladie de Parkinson, la maladie de Huntington, la maladie de Duchenne etc.);
• chaque objet a des caractéristiques qui lui sont propres (exemple : nom de la maladie en français = maladie de Duchenne, nom de la maladie en anglais = Duchenne muscular dystrophy, code = DMD , famille de maladies = dystrophie musculaire etc.).