La veille scientifique : l'utilisation de PubMed
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Organisation du MeSH
L'organisation hiérarchique
Le MeSH est organisé selon une arborescence avec des niveaux hiérarchiques qui partent des termes génériques jusqu'aux termes spécifiques.
Les descripteurs du MeSH sont regroupés en 16 catégories. Au fur et à mesure que l'on descend les onze niveaux de la hiérarchie, les termes sont de plus en plus spécifiques.
A - Anatomie
B - Organismes
C - Maladies
D - Produits chimiques et pharmaceutiques
E - Équipements et techniques analytiques, diagnostiques et thérapeutiques
F - Psychiatrie et psychologie
G - Sciences biologiques
H - Sciences naturelles
I - Anthropologie, enseignement, sociologie et phénomènes sociaux
J - Technologie, industrie et agriculture
K - Sciences humaines
L - Sciences de l'information
M - Individus
N - Santé
V - type de publication
Z - Lieux géographiques
La catégorie C (Maladies) comprend 23 subdivisions.
Maladies
Infections bactériennes et mycoses [C01]
Maladies virales [C02]
Maladies parasitaires [C03]
Tumeurs [C04]
Maladies de l'appareil locomoteur [C05]
Maladie de l'appareil digestif [C06]
Maladies du système stomatognathique [C07]
Maladies de l'appareil respiratoire [C08]
Maladies oto-rhino-laryngologiques [C09]
Maladies du système nerveux [C10]
Maladies de l'oeil [C11]
Maladies urologiques et appareil génital mâle [C12]
Maladies de l'appareil génital féminin et complications de la grossesse [C13]
Maladies cardiovasculaires [C14]
Hémopathies et maladies lymphatiques [C15]
Maladies et malformations congénitales, héréditaires et néonatales [C16]
Maladies de la peau et du tissu conjonctif [C17]
Maladies métaboliques et nutritionnelles [C18]
Maladies endocriniennes [C19]
Maladies du système immunitaire [C20]
Troubles liés à l'environnement [C21]
Maladies animales [C22]
Signes et symptômes, états pathologiques [C23]
La polyhiérarchie
Un même terme peut appartenir à plusieurs catégories du MeSH. Dans chacune de ces catégories, un numéro alphanumérique (Tree number) lui est attribué : une lettre précise la catégorie (C = Maladies) et une série de nombres renseigne sur la position du terme dans l'arborescence. Par exemple, pour le descripteur "Hépatite C" :
Maladies[C] -->maladies virales [C02] --> hépatites virales humaines [C02.440] -->hépatite C [C02.440.440]
Maladies[C] -->maladies virales [C02] --> infections à virus à ARN [C02.782] --> infections à Flaviviridae [C02.782.350] --> hépatite C [C02.782.350.350]
Maladies[C] --> maladies de l'appareil digestif [C02] --> maladies du foie [C06.552] --> hépatites [C06.552.380] --> hépatites virales humaines [C06.552.380.705] --> hépatite C [C06.552.380.705.440]
Ainsi ce descripteur a 3 localisations dans l'arborescence du thésaurus . La consultation du thésaurus peut permettre de connaître les différents aspects ou contextes (par exemple, les localisations anatomiques, les agents pathogènes, etc.) d'une maladie.
L'organisation sémantique
Le MeSH est aussi organisé selon des relations sémantiques.
Pour chaque concept, un terme préférentiel est désigné et il est utilisé lors de l'indexation. Les synonymes (Entry terms) renvoient au terme préférentiel lors de l'interrogation de PubMed par les utilisateurs. Ces synonymes sont parfois des termes plus spécifiques pour lesquels il n'y a pas eu création d'un concept MeSH spécifique.
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